免费凡客建站官网,设计图片背景,yw开头的网络黄页,wordpress引用视频taxize#xff08;第二部分#xff09; 3. taxize 文档中译3.10. classification#xff08;根据类群ID检索分类阶元层级#xff09;示例1#xff1a;传递单个ID值示例2#xff1a;传递多个ID值示例3#xff1a;传递单个名称示例4#xff1a;传递多个名称示例5#xf… taxize第二部分 3. taxize 文档中译3.10. classification根据类群ID检索分类阶元层级示例1传递单个ID值示例2传递多个ID值示例3传递单个名称示例4传递多个名称示例5传递字符型ID示例6传递带数据源的ID示例7传递多个数据库示例8横向/纵向组合示例9传递多个类群至多个数据库示例10查找维基物种 3.11. comm2sci根据俗名检索科学名3.12. sci2comm根据科学名检索俗名3.13. eol_dataobjects根据数据对象的标识符返回有关该对象的所有元数据3.14. eol_pages根据taxonconceptID查找EOL的网页内容3.15. eol_search从EOL数据源搜索术语3.16. eubon_capabilitiesEUBON的功能支持3.17. eubon_children3.18. eubon_hierarchy3.19. eubon_search3.20. fungorumfg数据库的一系列方法3.21. gbif_downstream从GBIF上根据分类信息向下检索所有分类名称3.22. gbif_name_usage在 GBIF 的所有分类标准中查找特定名称的详细信息3.23. gbif_parse使用 GBIF 名称解析器解析分类群名称 3. taxize 文档中译
资源https://cran.r-project.org/web/packages/taxize/taxize.pdf
介绍函数方法时并不严格遵循文档的顺序。
3.10. classification根据类群ID检索分类阶元层级
用法
classification(...)## Default S3 method:
classification(sci_id, dbNULL, calloptslist(), return_idTRUE, rowsNA, xNULL, ...)## S3 method for class tsn
classification(id, return_idTRUE, ...)## S3 method for class uid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, batch_size-50, max_tries3, ...)## S3 method for class eolid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class tpsid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class gbifid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class nbnid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class tolid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class wormsid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class natservid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class boldid
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class wiki
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class pow
classification(id, calloptslist(), return_idTRUE, ...)## S3 method for class ids
classification(id, ...)## S3 method for class classification
cbind(...)## S3 method for class classification
rbind(...)## S3 method for class classification_ids
cbind(...)## S3 method for class classification_ids
rbind(...)参数
…对于classification而言此项包括传递给get_tsn()get_uid()get_eolid()get_tpsid()get_gbifid()get_wormsid()get_natservid()get_wiki()get_pow()的参数。对于rbind.classification和cbind.classification此项则是classification类的单个或多个对象。sci_id用于检索的类群名称字符型或ID字符型或数值型向量。当db“eol”EOL期望你传递的是一个类群id即*get_eolid()*返回值。db字符型检索数据库。任一ncbiitiseoltropicosgbifnbnwormsnatservboldwiki或pow。每个数据库都有自己的一套标识符如果提供不属于数据库的标识符尽管有可能返回结果但基本上不是期望值。如果使用了ncbi/tropicos建议使用API密钥详见taxize-authentication。callopts传递给crul::verb-GET的curl选项。return_id逻辑值默认为TRUE返回类群id和名称以及阶元。数据库natserv将忽略此参数。rows数值型从1到无穷大的整数。默认为NA所有行都有效。如果你传递的是类群id而不是类群名称此参数被忽略。x已弃用请使用sci-id。id数值型标识符由 get_tsn()get_uid()get_eolid()get_tpsid()get_gbifid()get_wormsid()get_natservid()get_wiki()get_pow() 返回的结果。batch_size数值型针对NCBI请求指定每次请求查找的ID数量。max_tries数值型针对NCBI请求当首次请求失败时决定再尝试请求的次数。
说明如果你直接传递了ID值而不是get_*系列方法的返回值那么你必须指定ID归属的数据库。目前NBN不会在返回的分类信息中包含请求类群。
返回值由每个请求类群的分类信息的数据框组成的命名列表。
EOLEOL的无错误处理并不友好。比如如果你传递了一个并不存在的ID值那么EOL将返回500 HTTP错误。
NCBI请求限制以防万一你触发了NCBI的请求速率限制导致出错参考taxize_options()你可以设置ncbi_sleep。
NCBI请求的HTTP版本本方法硬编码了http_version2L以便让HTTP请求使用HTTP/1.1访问Entrez API。详见curl::curl_symbols(“CURL_HTTP_VERSION”)。
示例1传递单个ID值
classification(9606, dbncbi)示例2传递多个ID值
c - classification(c(9606, 55062), dbncbi)示例3传递单个名称
classification(Helianthus annuus, dbpow)示例4传递多个名称
c - classification(c(Helianthus annuus, Mahonia bealei), dbpow)示例5传递字符型ID
classification(134717, dbnatserv)示例6传递带数据源的ID
classification(as.nbnid(NBNSYS0000004786))c - classification(get_gbifid(c(Poa annua, Bison bison)))示例7传递多个数据库
out - get_ids(Puma concolor, db c(ncbi,gbif))cl - classification(out)示例8横向/纵向组合 cb - cbind(cl)rb - rbind(cl)示例9传递多个类群至多个数据库
out - get_ids(c(Puma concolor,Accipiter striatus), db c(ncbi,itis))cl - classification(out)示例10查找维基物种
classification(Malus domestica, db wiki)✔ Found: Malus domestica
══ Results ═════════════════• Total: 1
• Found: 1
• Not Found: 0
$Malus domesticaname rank
1 Eukaryota Superregnum
2 Plantae Regnum
3 Angiosperms Cladus
4 Eudicots Cladus
5 Core eudicots Cladus
6 Rosids Cladus
7 Eurosids I Cladus
8 Rosales Ordoattr(,class)
[1] classification
attr(,db)
[1] wiki
attr(,wiki_site)
[1] species
attr(,wiki)
[1] en
3.11. comm2sci根据俗名检索科学名
用法
comm2sci(...)## Default S3 method:
comm2sci(com, dbncbi, itisbysearch, simplifyTRUE, commnamesNULL, ...)## S3 method for class tsn
comm2sci(id, dbncbi, itisbysearch, simplifyTRUE, ...)## S3 method for class uid
comm2sci(id, dbncbi, itisbysearch, simplifyTRUE, ...)参数
…传递给内部调用函数的参数。com单个或多个俗名或部分名称。db数据源任一ncbi默认itistropicoseol或worms。我们建议通过获取API密钥使用ncbi数据库参考taxize_authentication。itisby在整个名称中搜索俗名默认search在名称起始位置搜索begin在名称末尾搜索end。simplify逻辑值为TRUE时返回名称向量。为FALSE时从各种数据源返回所有可能的结果通常是一个数据框。commnames已弃用请使用com。id类群标识符由*get_tsn()或get_uid()*返回。
说明当针对ITIS和NCBI数据库时可以直接传递俗名或者通过*get_uid()或get_tsn()*先获取id再传递给此函数。而针对其他数据库仅能传递俗名。
返回值如果simplifyTRUE一列科学名会出现在传入的名称的后面。如果simplifyFALSE返回一个数据框根据不同的数据源而包含不同的列。如果没有成功匹配则返回character(0)。
NCBI请求限制以防万一你触发了NCBI的请求速率限制导致出错参考taxize_options()你可以设置ncbi_sleep。
NCBI请求的HTTP版本本方法硬编码了http_version2L以便让HTTP请求使用HTTP/1.1访问Entrez API。详见curl::curl_symbols(“CURL_HTTP_VERSION”)。
示例 只传递一个俗名 comm2sci(comamerican black bear)$american black bear
[1] Ursus americanus传递多个俗名 comm2sci(comc(annual blue grass,tree of heaven), dbtropicos)$annual blue grass
[1] Poa annua$tree of heaven
[1] Toxicodendron altissimum传递ID x - get_uid(western capercaillie, modifier Common Name)
comm2sci(x)$100830
[1] Tetrao urogallus3.12. sci2comm根据科学名检索俗名
用法
sci2comm(...)## Default S3 method:
sci2comm(sci, dbncbi, simplifyTRUE, scinamesNULL, ...)## S3 method for class uid
sci2comm(id, ...)## S3 method for class tsn
sci2comm(id, simplifyTRUE, ...)## S3 method for class wormsid
sci2comm(id, simplifyTRUE, ...)## S3 method for class iucn
sci2comm(id, simplifyTRUE, ...)参数
…传递给*get_uid()和get_tsn()*的参数。sci字符型单个或多个科学名或部分名称。db字符型数据源任一ncbi默认、itis、eol、worms或iucn。每个数据库都有自己的一套标识符如果提供不属于数据库的标识符尽管有可能返回结果但基本上不是期望值。我们建议在使用ncbi或iucn时添加API密钥参考taxize-authentication。simplify逻辑值为TRUE时只返回名称向量。为FALSE时返回一个数据框数据源不同导致包含的列不同。仅适用于eol和itis。指定FALSE以获取eol和itis的输出中每种方言的语言。scinames已弃用请使用sci。id字符型类群标识符由*get_tsn()或get_uid()*返回。
返回值字符向量列表根据传入的类群名称或类群ID命名。匹配失败返回character(0)。
NCBI请求的HTTP版本本方法硬编码了http_version2L以便让HTTP请求使用HTTP/1.1访问Entrez API。详见curl::curl_symbols(“CURL_HTTP_VERSION”)。
示例 传递单个科学名 sci2comm(sciHelianthus annuus)$Helianthus annuus
[1] common sunflower传递多个科学名 sci2comm(scic(Helianthus annuus, Poa annua))$Helianthus annuus
[1] common sunflower$Poa annua
character(0)传递id值 sci2comm(get_uid(Helianthus annuus))$4232
[1] common sunflower3.13. eol_dataobjects根据数据对象的标识符返回有关该对象的所有元数据
用法
eol_dataobjects(id, taxonomyTRUE, languageNULL, ...)参数
id字符值EOL数据对象标识符。taxonomy逻辑值决定是否返回类群阶元层级的详细信息存储在taxonconcepts数组。language字符型结果使用哪种语言。可用值有ms、de、en、es、fr、gl、it、nl、nb、oc、pt-BR、sv、tl、mk、sr、uk、ar、zh-Hans、zh-Hant和ko。…传递给crul::HttpClient的可选参数。
说明EOL API支持返回JSON或XML而此方法只能返回JSON。
返回值一个列表当taxonomyTRUE时还会返回一个数据框。
3.14. eol_pages根据taxonconceptID查找EOL的网页内容
用法
eol_pages(taxonconceptID, images_per_page NULL, images_page NULL, videos_per_page NULL, videos_page NULL, sounds_per_page NULL, sounds_page NULL, maps_per_page NULL, maps_page NULL, texts_per_page NULL, texts_page NULL, subjects overview, licenses all, details FALSE, common_names FALSE, synonyms FALSE, references FALSE, taxonomy TRUE, vetted 0, cache_ttl NULL, ...参数
taxonconceptID数值型一个taxonconceptID也是页码。images_per_page整数型返回的图片数量0-75。images_page整数型图片页。videos_per_page整数型返回的影像数量0-75。videos_page整数型影像页。sounds_per_page整数型返回的录音数量0-75。sounds_page整数型录音页。maps_per_page整数型返回的地图数量0-75。maps_page整数型地图页。texts_per_page整数型返回的文本数量0-75。texts_page整数型文本页。subjects为overview时默认返回概述只要存在管道符 | 通过标题名进行筛选。为all时返回所有文本。licenses通过管道符筛选许可证或者all选择所有许可证。details默认为FALSE。包含所有元数据。common_names默认为FALSE。返回所有俗名。synonyms默认为FALSE。返回所有异名。references默认为FALSE。返回所有文献。taxonomy逻辑型默认为TRUE。决定是否返回任何详细的分类信息存储在taxonconcepts数组。vetted默认为FALSE。如果为*‘1’只返回可信的内容。如果为‘2’*只返回可信的和未审阅的内容而不可信内容不会返回。默认返回所有内容。cache_ttl希望缓存响应的秒数。…传递给crul::HttpClient的参数。
说明EOL API支持返回JSON或XML而此方法只能返回JSON。
返回值JSON列表或数据库。
示例
pageid - eol_search(Pomatomus)$pageid[1]x - eol_pages(taxonconceptID pageid)z - eol_pages(taxonconceptID pageid, synonyms TRUE)z - eol_pages(taxonconceptID pageid, common_names TRUE)
z$vernacularvernacularname language eol_preferred
1 bluefish en TRUE3.15. eol_search从EOL数据源搜索术语
用法
eol_search(sci, page1, exactNULL, filter_tidNULL, filter_heidNULL, filter_by_stringNULL, cache_ttlNULL, termsNULL, ...)参数
sci字符型科学名。page每页最多返回30条结果。此参数允许你获取多个页面以防结果大于30条默认为1。exact查找类群页面只要优先名称、任何异名或俗名与检索术语完全匹配。filter_tid根据EOL页面ID将搜索结果限制在分类群的成员内。filter_heid根据分类层级条目ID将搜索结果限制在分类群的成员内。filter_by_string根据搜索术语进行绝对检索匹配页面将作为分类群对搜索结果进行筛选。cache_ttl希望缓存响应的秒数。…传递给crul::HttpClient的参数。
说明EOL API支持返回JSON或XML而此方法只能返回JSON。
返回值
包含四列的数据框 pageid页面ID与使用get_eolid() 返回的eolid相同。name分类名称不一定包含命名人。link请求URL。content由分号分隔的名称组成的字符串。需要由用户来发掘它是否包含有用的信息。
示例 e - eol_search(sciHomo)3.16. eubon_capabilitiesEUBON的功能支持
用法eubon_capabilities(...)
参数…传递给crul::verb-GET的curl可选项参数。
示例eubon_capabilities() 3.17. eubon_children
用法eubon_children(id, providers NULL, timeout 0, ...)
参数
id字符型类群的ID。包括LSIDDOIURI或任何由清单中的供应商提供的标识符。providers字符型由逗号字符连接的供应商id字符串列表。默认为pesi,bgbm-cdm-server[col]。可以从’ /capabilities 服务端点获得所有可用供应商id的列表。供应商可以嵌套也就是说父供应商可以有子供应商。如果提供了父供应商的id将查询所有子供应商。还可以使用以下语法将查询限制为一个或多个子供应商:parent-id[sub-id-1,sub-id2…]timeout数值型等待任何供应商的响应的最大毫秒数。如果超过了响应时间服务将只返回到目前为止已经接收到的响应。默认超时为0毫秒(永远等待)。…传递给crul::verb-GET的curl可选项参数。
返回值一个数据框或者没有找到结果的话就返回一个空列表。
说明此方法中没有分页因此您可能会也可能不会获得搜索的所有结果。
示例x - eubon_children(id urn:lsid:marinespecies.org:taxname:126141, providers worms)
3.18. eubon_hierarchy
用法eubon_hierarchy(id, providers pesi, timeout 0, ...)
参数
id字符型类群的ID。包括LSIDDOIURI或任何由清单中的供应商提供的标识符。providers字符型由逗号字符连接的供应商id字符串列表。默认为pesi,bgbm-cdm-server[col]。可以从’ /capabilities 服务端点获得所有可用供应商id的列表。供应商可以嵌套也就是说父供应商可以有子供应商。如果提供了父供应商的id将查询所有子供应商。还可以使用以下语法将查询限制为一个或多个子供应商:parent-id[sub-id-1,sub-id2…]timeout数值型等待任何供应商的响应的最大毫秒数。如果超过了响应时间服务将只返回到目前为止已经接收到的响应。默认超时为0毫秒(永远等待)。…传递给crul::verb-GET的curl可选项参数。
返回值一个数据框或者没有找到结果的话就返回一个空列表。
说明此方法中没有分页因此您可能会也可能不会获得搜索的所有结果。
示例eubon_hierarchy(id urn:lsid:marinespecies.org:taxname:126141, worms)
3.19. eubon_search
用法
eubon_search(query, providerspesi, searchModescientificNameExact, addSynonymyFALSE, addParentTaxonFALSE, timeout0, dedupNULL, limit20, page1, ...)参数
query字符型搜索的科学名。这是一个精确搜索因此不支持通配符。providers字符型逗号字符连接的供应商id字符串列表。默认为pesi,bgbm-cdm-server[col]。可以从’ /capabilities 服务端点获得所有可用供应商id的列表。供应商可以嵌套也就是说父供应商可以有子供应商。如果提供了父供应商的id将查询所有子供应商。还可以使用以下语法将查询限制为一个或多个子供应商:parent-id[sub-id-1,sub-id2…]。searchMode字符型指定搜索模式。可能的搜索模式有:scientificNameExact, scientificNameLike(以开头)vernacularnamexact, vernacularNameLike(contains) findByIdentifier。如果供应商不支持所选的搜索模式它将被跳过并且tnrClientStatus中的状态消息将被设置为“不支持的搜索模式”。addSynonymy逻辑型指示是否应将接受的分类单元的同义词包含在响应中。打开此选项可能会增加响应时间。默认为FALSE。addParentTaxon逻辑型表示所接受分类群的父分类群是否应包含在响应中。打开此选项可能会导致响应时间略有增加。默认为FALSE。timeout数值型等待任何供应商的响应的最大毫秒数。如果超过了响应时间服务将只返回到目前为止已经接收到的响应。默认超时为0毫秒(永远等待)。dedp数值型通过使用重复数据删除策略可以对结果进行重复数据删除。重复计算是通过比较分类群的特定属性来完成的 id对比taxon.identifier。id_name对比taxon.identifier和taxon.taxonName.scientificName。name对比taxon.taxonName.scientificName。不推荐使用此策略。 limit数值型/整数型返回的记录数量。默认为20。此参数只影响scientificNameLike和vernacularNameLike其余搜索模式每个检查列表只返回一条记录。page数值型/整数型返回的页面。默认为1.此参数只影响scientificName和vernacularNameLike其余搜索模式每个检查列表只返回一条记录。…传递给crul::verb-GET的curl可选项参数。
示例eubon_search(Prionus)
3.20. fungorumfg数据库的一系列方法
描述在全球真菌名录中搜索发分类名称。
用法
fg_name_search(q, anywhereTRUE, limit10, ...)
fg_author_search(q, anywhereTRUE, limit10, ...)
fg_epithet_search(q, anywhereTRUE, limit10, ...)
fg_name_by_key(key, ...)
fg_name_full_by_lsid(lsid, ...)
fg_all_updated_names(date, ...)
fg_deprecated_names(date, ...)参数
q字符型查询词。anywhere逻辑型默认为TRUE。limit整数型返回的结果数量。最大值为6000.…传递给crul::verb-GET的curl可选项参数。key字符型一个全球真菌名录的类群key。lsid字符型一个LSID例如urn:lsid:indexfungorum.org:names:81085。date字符型日期格式如下YYYMMDD。
返回值一个数据框或者如果没有结果就返回NULL。
示例
f - fg_name_search(q Gymnopus)f - fg_epithet_search(q phalloides)f - fg_name_by_key(17703)f - fg_name_full_by_lsid(urn:lsid:indexfungorum.org:names:81085)f - fg_all_updated_names(date gsub(-, , Sys.Date() - 2))f - fg_deprecated_names(date20151001)f - fg_author_search(q Fayod, limit 2)3.21. gbif_downstream从GBIF上根据分类信息向下检索所有分类名称
用法
gbif_downstream(id, downto, intermediateFALSE, limit100, startNULL, keyNULL, ...)参数
id一个分类学序列号。downto您希望深入到的分类阶元。请参见下面的示例。分类级别区分大小写必须拼写正确。拼写请参见数据 (rank_ref)。intermediate逻辑型为TRUE时则返回包含目标分类群等级名称的长度为 2 的列表、 附加的中间分类群 data.frame 列表。默认为FALSE。limit要返回的记录数。默认值100最大值1000 与start参数结合使用。start返回记录的起始编号。默认为0。与limit参数结合使用。key已弃用请使用id。…传递给gbif_name_usage() 的参数。
说明有时记录中没有我们要查找的规范名称条目。在这种情况下我们会抓取scientificName。您可以在 name_type 列中看到所收集的名称类型。
返回值从目、类等到科的下游分类信息的 data.frame或者如果 intermediatedTRUE则返回长度为 2 的列表包含目标分类群等级名称和中间名称。
示例
gbif_downstream(id 198, downtogenus)name rank key name_type
1 Allogonium genus 2651958 canonicalname
2 Bangia genus 2653776 canonicalname
3 Bangiomorpha genus 4907128 canonicalname
4 Boreophyllum genus 6102075 canonicalname
5 Clymene genus 8203169 canonicalname
6 Conchocelichnus genus 12349604 canonicalname
7 Dione genus 7952618 canonicalname
8 Fuscifolium genus 6784971 canonicalname
9 Kuwaitiella genus 12275417 canonicalname
10 Lysithea genus 6784972 canonicalname
11 Minerva genus 4376334 canonicalname
12 Neomiuraea genus 10933480 canonicalname
13 Neoporphyra genus 10840017 canonicalname
14 Neopyropia genus 11224418 canonicalname
15 Neothemis genus 10040559 canonicalname
16 Palaeoconchocelis genus 4922773 canonicalname
17 Phycocalidia genus 11328097 canonicalname
18 Porphyra genus 2653483 canonicalname
19 Porphyrea genus 4602743 canonicalname
20 Porphyrella genus 2653774 canonicalname
21 Pseudobangia genus 4376337 canonicalname
22 Pyropia genus 4908866 canonicalname
23 Spermogonia genus 4907552 canonicalname
24 Themis genus 8274639 canonicalname
25 Uedaea genus 11329911 canonicalname
26 Wildemania genus 2653758 canonicalname
27 Wildemania genus 9738674 canonicalname
28 Zachariasia genus 2653756 canonicalname
29 Granufilum genus 7632635 canonicalname
30 Chroodactylon genus 2665908 canonicalname
31 Stylonema genus 7864726 canonicalname3.22. gbif_name_usage在 GBIF 的所有分类标准中查找特定名称的详细信息
描述这是 rgbif 软件包中相同函数的税化版本因此无需导入 rgbif也就无需安装 GDAL 二进制程序。
用法
gbif_name_usage(keyNULL, nameNULL, dataall, languageNULL, datasetKeyNULL, uuidNULL, sourceIdNULL, rankNULL, shortnameNULL, startNULL, limit20, ...)参数
key数值型一个类群的GBIF 密钥。name字符型通过不区分大小写的规范名称字符串进行筛选。data字符型指定一个选项以选择返回哪些数据。language字符型语言类型。默认为英语。datasetKey字符型通过数据集的键uuid进行筛选。uuid字符型数据集的 uuid。结果应与 datasetKey 完全相同。sourceId数值型根据源标识符进行筛选。目前尚未使用。rank字符型分类等级。根据以下分类等级之一进行筛选CLASS, CULTIVAR, CULTIVAR_GROUP, DOMAIN, FAMILY, FORM, GENUS, INFORMAL, INFRAGENERIC_NAME, INFRAORDER, INFRASPECIFIC_NAME,INFRASUBSPECIFIC_NAME, KINGDOM, ORDER, PHYLUM, SECTION,SERIES, SPECIES, STRAIN, SUBCLASS, SUBFAMILY, SUBFORM, SUBGENUS, SUBKINGDOM, SUBORDER, SUBPHYLUM, SUBSECTION, SUBSERIES, SUBSPECIES, SUBTRIBE, SUBVARIETY, SUPERCLASS, SUPERFAMILY, SUPERORDER, SUPERPHYLUM, SUPRAGENERIC_NAME, TRIBE,UNRANKED, VARIETYshortname字符型简称。shart返回记录的起始编号。limit要返回的记录数。…传递给crul::HttpClient的可选参数。
返回值长度为 2 的列表。第一个元素是元数据。第二个元素是 data.frameverboseFALSE默认或列表verboseTRUE。
3.23. gbif_parse使用 GBIF 名称解析器解析分类群名称
用法gbif_parser(scientificname, ...)
参数
scientificname字符型科学名。…传递给crul::verb-POST的可选参数。
返回值包含从已解析的分类群名称中提取的字段的 data.frame。返回的字段是从科学名称scientificname中的所有物种名称中提取的字段的组合。
示例
gbif_parse(scientificnamex Agropogon littoralis)scientificname type genusorabove specificepithet notho parsed parsedpartially canonicalname
1 x Agropogon littoralis SCIENTIFIC Agropogon littoralis GENERIC TRUE FALSE Agropogon littoraliscanonicalnamewithmarker canonicalnamecomplete rankmarker
1 ×Agropogon littoralis ×Agropogon littoralis sp.
